菌群失调不但和各种消化系统疾病，如幽门螺杆菌感染、肠易激综合征、炎症性肠病等密切相关，

还和代谢性疾病如冠心病、高血压、肥胖、糖尿病等，各种神经系统疾病如帕金森病、自闭症、焦虑症、忧郁症等，过敏性疾病如过敏性鼻炎、哮喘等，以及肿瘤等都有着千丝万缕的联系。